Trong 'Máy Bay Mất Tích (Phần 2) - Manifest (Season 2)', chuyến bay định mệnh số hiệu 828 hạ cánh xuống đường băng, mang theo sự nhẹ nhõm tột cùng cho toàn bộ hành khách và phi hành đoàn sau một hành trình đầy xáo trộn. Thế nhưng, khoảnh khắc bình yên ấy nhanh chóng tan biến khi họ nhận ra một sự thật kinh hoàng: hơn năm năm đã trôi qua kể từ khi chiếc máy bay cất cánh. Thế giới mà họ từng biết đã tiếp tục cuộc sống mà không có họ; gia đình, bạn bè và đồng nghiệp đã đau khổ chấp nhận cái chết của họ và bắt đầu xây dựng lại cuộc sống mới. Sự trở lại đột ngột và không thể giải thích được của chuyến bay 828 đã đánh dấu một khởi đầu cho những điều kỳ lạ và bí ẩn. Điều gì thực sự đã xảy ra trên chuyến bay ấy? Những hành khách và phi hành đoàn, giờ đây được gọi là 'Những người trở về', phải đối mặt với một thế giới xa lạ, những mối quan hệ phức tạp và những 'lời kêu gọi' đầy ám ảnh thôi thúc họ tìm ra sự thật phía sau sự kiện phi thường này, trước khi quá muộn. Liệu họ có thể khám phá ra bí mật khủng khiếp, hay số phận đã định sẵn một kết cục nghiệt ngã cho tất cả?